L’ADN environnemental (ADNe) se définit comme l’ADN pouvant être extrait d'échantillons environnementaux (tels que le sol, l'eau ou l'air) sans avoir besoin d'isoler au préalable des individus cibles. Cette méthode est complémentaire aux actuelles techniques d’inventaire, en permettant notamment la détection des espèces présentes en faible abondance ou discrètes.
Cistude Nature a contribué aux premiers tests de cette technique en Aquitaine en prenant comme modèle la Grenouille taureau (Lithobates catesbelanus).
Actuellement, en partenariat avec l'entreprise SPYGEN qui maitrise cette technique d'ADNe, Cistude NAture réalisent des prélèvements d'eau pour améliorer la détectabilité du Campagnol amphibie (Arvicola sapidus).