La Grenouille des Pyrénées est une grenouille brune de petite taille (6 cm max), d'apparence plutôt svelte. Elle se distingue de la Grenouille rousse grâce à ses plis dorso-latéraux peu marqués, et surtout un tympan quasi invisible. Sa robe unie tire généralement sur le rougeâtre. Les têtards noirs pailletés de points blancs ou dorés sont caractéristiques de l'espèce.



La Grenouille des Pyrénées est souvent confondue avec les petits individus de Grenouille rousse Rana temporaria, plutôt commune dans les Pyrénées. Cette dernière présente des plis latéro-dorsaux plus marqués, et un tympan plus visible. La forme globale diffère également.