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En janvier 2016, est paru le dernier tome de l'atlas des Mammifères sauvages d'Aquitaine qui concerne les Rongeurs, les Erinaceomorphes et les Soricomorphes. Voici les cartes de répartition des 32 espèces présentes dans la région au format 10kmx10km (Lambert 93). Sauf mention contraire, les données sont issues d'une période comprise entre 2005 et 2015.
Campagnol agreste (Microtus agrestis)
Campagnol amphibie (Arvicola sapidus)
Campagnol basque (Microtus lusitanicus)
Campagnol des champs (Microtus arvalis)
Campagnol fouisseur (Arvicola scherman)
Campagnol de Gerbe (Microtus gerbei)
Campagnol des neiges (Chionomys nivalis)
Campagnol roussâtre (Clethrionomys glareolus)
Campagnol souterrain (Microtus subterraneus)
Crocidure des jardins (Crocidura suaveolens)
Crocidure musette (Crocidura russula)
Crossope aquatique (Neomys fodiens)
Desman des Pyrénées (Galemys pyrenaicus) - en zones hydrographiques
Ecureuil roux (Sciurus vulgaris)
Hérisson d'Europe (Erinaceus europaeus)
Lérot (Eliomys quercinus)
Marmotte des Alpes (Marmota marmota)
Mulot à collier (Apodemus flavicollis)
Mulot sylvestre (Apodemus sylvaticus)
Musaraigne carrelet (Sorex araneus)
Musaraigne couronnée (Sorex coronatus)
Musaraigne pygmée (Sorex minutus)
Pachyure étrusque (Suncus etrucus)
Ragondin (Myocastor coypus) - zones hydrographiques
Rat des moissons (Micromys minutus)
Rat musqué (Ondatra zibethicus) - zones hydrographiques
Rat noir (Rattus rattus)
Rat surmulot (Rattus norvegicus)
Souris domestique (Mus musculus domesticus)
Souris à queue courte (Mus spretus)
Taupe d'Europe (Talpa europaea)
